Если после получения предоплаты внесены изменения в договор в части уменьшения налоговой ставки, к вычету принимается и сумма НДС, соответствующая объему реализации, и сумма НДС, оказавшаяся излишней.
Письмо Минфина от 25 сентября 2025 г. № 03-04-05/93110.
Авансовый НДС можно принять к вычету в сумме, указанной в счете-фактуре на отгрузку (Закон от 21 июля 2014 г. № 238-ФЗ). То есть вычету подлежит та сумма НДС, которая относится к отгруженному товару (выполненным работам, оказанным услугам, переданным имущественным правам) (п. 6 ст. 172 НК РФ).
Если поставщик, получивший предоплату, по которой НДС был уплачен по расчетной ставке 20/120, в следующих периодах отгрузил в счет нее товары, облагаемые НДС по ставке 10%, то НДС, исчисленный с предоплаты по ставке 20/120 возвращается покупателю. При этом в договор о реализации товаров должны быть внесены изменения, согласно которым стоимость товаров уменьшена на соответствующую сумму НДС.
То есть ситуация аналогична той, когда авансовый НДС принимается к вычету после расторжения или изменения условий договора и возврате покупателю части уплаченной суммы по договору.