Согласно пп. 16 п. 3 ст. 149 Кодекса НДС на научно-исследовательские и опытно-конструкторские работ, выполняемые за счет бюджетных средств, не начисляется. Это же правило касается и соисполнителей (субподрядчиков), привлечение которых к выполнению рассматриваемых работ законом не запрещено. Вместе с тем, НК РФ не урегулирован вопрос о том, какими документами можно подтвердить правомерность освобождения от налогообложения в соответствии с указанной статьей.
Компании, выполняющие научно-исследовательские и опытно-конструкторские работы за счет средств федерального бюджета, а также их соисполнители и субодрядчики, могут получить эту льготу, если представят договор на выполнение работ с указанием источника финансирования, а также письменное уведомление (справку) заказчика, получившего средства на оплату работ из бюджета.