Налоговая база должна исчисляться по итогам каждого налогового периода. При этом, если за прошлые периоды налоговая база была рассчитана с ошибками, перерасчет производится в текущем периоде за предыдущие, когда были допущены эти ошибки.
Исчисление налогов, учитываемых в составе расходов, в излишнем размере не рассматривается как ошибка при исчислении налога на прибыль организаций.
Поэтому если компания в последующих периодах подает исправленную декларацию в связи с обнаруженной переплатой по транспортному налогу, исправления надо рассматривать как новое обстоятельство, а саму переплату учитывать в составе внереализационного дохода в текущем периоде.