Если арендодателем является бюджетное учреждение, которому имущество передано в оперативное управление, а не орган власти, арендатор не становится налоговым агентом по НДС.
Письмо Минфина от 16 июня 2025 г. № 03-07-11/57831.
При аренде у государственного органа или органа местного самоуправления федерального,
муниципального имущества, а также имущества субъекта РФ организации и ИП признаются налоговыми агентами по НДС. В качестве налогового агента они обязаны исчислить, удержать из доходов арендодателя и уплатить в бюджет налог (п. 3 ст. 161 НК РФ).
В то же время обязанности налоговых агентов у арендаторов не возникают, если арендодателем выступает государственное (муниципальное) бюджетное учреждение, за которым госимущество закреплено на праве оперативного управления, а не непосредственно орган власти.
Нормы НК РФ этого не предусматривают, а плательщиком НДС является само бюджетное учреждение. Оно должно исчислять и уплачивать НДС с арендной платы в общем порядке.