Доплата за работу с вредными и опасными условиями труда облагается НДФЛ, т.к. не является компенсацией.
Налогом не облагают все виды установленных законом компенсаций, которые выплачивают работнику и которые связаны с исполнением им трудовых обязанностей (п. 1 ст. 217 НК РФ).
Трудовой кодекс не рассматривает оплату труда в повышенном размере в качестве компенсационной выплаты. Поэтому НДФЛ нужно удерживать в общем порядке.
Кроме доплаты, работодатель может компенсировать работникам с вредными условиями труда их затраты. Такая дополнительная компенсация не облагается НДФЛ при условии документального подтверждения компенсаторного характера расходов. Компенсация должна быть подтверждена количественной оценкой затрат работника и иметь целевой характер. Иначе придется платить НДФЛ.