Счет-фактура имеет свое назначение и не заменяет ни платежные документы, ни акты выполненных работ.
Счет-фактура является документом, который оформляется наряду с платежным и (или) первичным учетным документом.
Это значит, что сам он таковыми не является, поскольку в состав реквизитов счета-фактуры входят реквизиты платежно-расчетного документа, а для подтверждения права на вычет нужны первичные документы (накладные, акты и др.).
Счет-фактура служит основанием для принятия покупателем предъявленных продавцом товаров (работ, услуг) сумм НДС к вычету (ст. 169 НК РФ). Вычет НДС осуществляется после принятия на учет приобретенных товаров, работ, услуг (ст. 172 НК РФ).